Boyabat, yaklaşık MÖ 3000 Yıllık geçmişi olan eski bir yerleşim merkezidir. İlçeyi simgeleyen Boyabat Kalesi MÖ 3000 yıllarına ait izler taşımaktadır.
Kurulduğundan bu zamana kadar Boyabat, sırası ile şu yönetimler altında bulunmuştur.
1- Gaşgaşlar : MÖ – 1400 – 1300
2- Hititler : MÖ – 1330 – 1200
3- Paflagonyalılar : MÖ – 1100 – 700
4- Lidyalılar : MÖ – 700 – 546
5- İranlılar : MÖ – 362
6- Pontuslar : MÖ – 183 – 64
7- Romalılar : MÖ- 64 MS- 365
8- Bizanslılar : MS – 395- 1126
Bizanslılardan sonra 1126 yılında Türk Beyliklerine geçen Boyabat daha sonra Osmanlı imparatorluğuna dahil olmuştur.
